Проверките са обхванали 16 проекта по програма ФАР, 5 по САПАРД и 8 по ИСПА. Констатирани са множество нередности. Като основна причина за забавянето на проектите се посочва бавната работа по сключването на тръжни процедури и договори. Проблем е и липсата на комуникация между институциите, а административният капацитет не е достатъчен.

Другият основен проблем е свързан с изпълнението на проектите. Сметната палата е установила още нарушения при контрола над изпълнението на проектите и тяхната законосъобразност, както и проблеми с документацията.